237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1474 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1474  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
211 aa  420  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1624  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  81.25 
 
 
212 aa  342  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.904613  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0290  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  79.33 
 
 
217 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1004  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  79.33 
 
 
212 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540991  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0073  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  67.76 
 
 
219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.690907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.98 
 
 
215 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.57 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2350  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.83 
 
 
211 aa  187  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2545  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.6 
 
 
225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1139  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.83 
 
 
209 aa  177  8e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00457344  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0629  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.32 
 
 
234 aa  177  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0183  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.39 
 
 
215 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0028  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.71 
 
 
216 aa  159  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684856  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0153  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  41.43 
 
 
212 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0683456  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1680  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.32 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1966  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  31.41 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1418  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.65 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0753  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.67 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1147  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.73 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1571  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.07 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0574999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2761  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.91 
 
 
277 aa  62.4  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.21 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1063  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.53 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0924  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.81 
 
 
238 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1332  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.65 
 
 
227 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.1 
 
 
276 aa  61.6  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 
266 aa  61.6  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.62 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.17 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.68 
 
 
237 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.17 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.41 
 
 
271 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2155  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  28.21 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.85 
 
 
272 aa  59.7  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.17 
 
 
275 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.47 
 
 
275 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0023  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.62 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.47 
 
 
275 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.17 
 
 
275 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.41 
 
 
271 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.47 
 
 
275 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.35 
 
 
242 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2903  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.09 
 
 
237 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.65 
 
 
210 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.65 
 
 
210 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0430  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.42 
 
 
279 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.85 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.39 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0031  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.93 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.58 
 
 
273 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  28.09 
 
 
513 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1724  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.78 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.297453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1299  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.31 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0387  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.12 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.69 
 
 
271 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.39 
 
 
275 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.39 
 
 
275 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.5 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.79 
 
 
272 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.39 
 
 
275 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.39 
 
 
275 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.39 
 
 
275 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.39 
 
 
275 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.39 
 
 
275 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.47 
 
 
270 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.59 
 
 
272 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0027  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.12 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.39 
 
 
275 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.45 
 
 
320 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1179  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.39 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0446  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.64 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733361  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0216  hexulose-6-phosphate synthase, putative  23.96 
 
 
210 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  28.57 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0730  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.43 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000744541 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2110  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.48 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.71 
 
 
302 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1862  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.55 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0932459  normal  0.0318257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1688  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.73 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0654719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  30 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.76 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.85 
 
 
259 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1687  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.89 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.660624  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.79 
 
 
281 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1278  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  25.33 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2920  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.19 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0072  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.11 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109683  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.57 
 
 
274 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.87 
 
 
288 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2068  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.13 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.78 
 
 
307 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.37 
 
 
276 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.11 
 
 
255 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0129  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.86 
 
 
241 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0638289  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0607  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.96 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0593  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.96 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2890  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.44 
 
 
240 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.92 
 
 
236 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1407  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.18 
 
 
235 aa  52  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0460  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.09 
 
 
230 aa  52.4  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1335  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.44 
 
 
240 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>