87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03433 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03433  3-keto-L-gulonate 6-phosphate decarboxylase  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03384  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0129  3-dehydro-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  99.09 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0133  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  99.09 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3785  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  99.09 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4078  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  97.73 
 
 		 220 aa  431  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3904  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  97.27 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4060  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  90.45 
 
 		 220 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3873  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  90.74 
 
 		 216 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3889  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  90 
 
 		 220 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3953  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  89.09 
 
 		 220 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3998  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  89.09 
 
 		 220 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.92923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3937  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  66.82 
 
 		 218 aa  288  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3696  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  64.49 
 
 		 218 aa  280  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3893  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  64.02 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0771  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  50.7 
 
 		 215 aa  218  7e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.366407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0292  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  52.56 
 
 		 214 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0962107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4726  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  45.37 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.491021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4757  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  45.37 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4440  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  45.37 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3817  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  45.37 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00572781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5712  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  45.37 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4667  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  45.37 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04025  hypothetical protein  45.37 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04063  3-keto-L-gulonate 6-phosphate decarboxylase  45.37 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4783  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  44.91 
 
 		 216 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.268129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4664  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  44.91 
 
 		 216 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482194  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4747  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  44.91 
 
 		 216 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4654  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  44.91 
 
 		 216 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4804  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  44.91 
 
 		 216 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3797  3-dehydro-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  45.37 
 
 		 216 aa  208  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0145  3-dehydro-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  46.05 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0127  3-dehydro-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  46.05 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0115  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  48.84 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0197016  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0987  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  47.44 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.304875  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1994  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  45.12 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1812  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  46.3 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3043  hexulose-6-phosphate synthase  31.96 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3049  hexulose-6-phosphate synthase  31.96 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1849  3-hexulose-6-phosphate synthase  30.23 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3212  3-hexulose-6-phosphate synthase  29.21 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.99 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.942951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1654  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.12 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000168104  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2929  3-hexulose-6-phosphate synthase  28.5 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000015488 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0227  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.88 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0096121 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1184  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.71 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0607  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.33 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3708  hexulose-6-phosphate synthase  30.88 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0593  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.33 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0250  hexulose-6-phosphate synthase  30.3 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000013709  normal  0.0274377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  33.33 
 
 		 389 aa  79  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0216  hexulose-6-phosphate synthase, putative  28.64 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.77 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.77 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.88 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  25.85 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.43 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  28.64 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  29.05 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5671  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.78 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.587401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.05 
 
 		 429 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1871  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.64 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.356021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2273  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.14 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.25 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0568  hexulose-6-phosphate synthase  35.26 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.64 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1686  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0279692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  27.91 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.45 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1830  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.35 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000143542  normal  0.0955115 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.57 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.07 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.17 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  30.2 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0131  hexulose-6-phosphate synthase  27.27 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.7 
 
 		 438 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  27.31 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0372  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.02 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  26.09 
 
 		 403 aa  55.5  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  23.5 
 
 		 413 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  27.17 
 
 		 393 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.77 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0028  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.36 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684856  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 221 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0153  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.73 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0683456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4774  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.18 
 
 		 229 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal  0.564771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>