More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2302 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.44 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  45.7 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.02 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  43.78 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  41.85 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.73 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  41.94 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  41.47 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.05 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  39.82 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  40.28 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.58 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  41.47 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.81 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  42.92 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  42.92 
 
 		 222 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  42.5 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.87 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  40.61 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  42.13 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.98 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  40.53 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.73 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.61 
 
 		 237 aa  144  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.69 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.08 
 
 		 450 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.82 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.43 
 
 		 187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.47 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  43.46 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.76 
 
 		 228 aa  137  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.64 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.32 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.97 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.67 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.05 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.05 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  40.96 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  35.75 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  35.29 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.59 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  34.84 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.35 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.64 
 
 		 413 aa  126  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  41.18 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  36.32 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.38 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.28 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.28 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  33.94 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  33.48 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  33.48 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  36.24 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  33.48 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.9 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  34.43 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.49 
 
 		 428 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  33.94 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.79 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.65 
 
 		 426 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.88 
 
 		 429 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.28 
 
 		 428 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.76 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  37.3 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.63 
 
 		 437 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.88 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  33.94 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.87 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  37.13 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1361  hypothetical protein  36.41 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  38.02 
 
 		 438 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.88 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  34.39 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.44 
 
 		 438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.85 
 
 		 429 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  36.75 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  30.45 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.45 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  31.19 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.41 
 
 		 438 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  34.56 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.2 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.13 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.23 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  35.94 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  36.41 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.75 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  35.94 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  30.41 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  32.02 
 
 		 248 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  33.73 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  31.46 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  31.65 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.13 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.11 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>