More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2021 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
207 aa  417  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  64.32 
 
 
219 aa  265  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  62.19 
 
 
207 aa  255  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  64.5 
 
 
205 aa  249  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  58.94 
 
 
206 aa  239  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  53.89 
 
 
205 aa  222  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  48.28 
 
 
237 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.89 
 
 
225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.64 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.62 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.93 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.11 
 
 
208 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.24 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  40.29 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.29 
 
 
232 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  38.89 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  36.45 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.89 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.04 
 
 
232 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.76 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  37.97 
 
 
223 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  36.99 
 
 
224 aa  111  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  35.75 
 
 
225 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  38.89 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  35.96 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.97 
 
 
233 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  33.16 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  35.35 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  39.2 
 
 
235 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.06 
 
 
230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.66 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 
216 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  35.71 
 
 
246 aa  108  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  35.64 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.76 
 
 
228 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.37 
 
 
223 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.17 
 
 
438 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.22 
 
 
204 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.42 
 
 
231 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.45 
 
 
231 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.67 
 
 
438 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.33 
 
 
232 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.33 
 
 
232 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  36.52 
 
 
233 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.89 
 
 
211 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.31 
 
 
236 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.17 
 
 
438 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  35.96 
 
 
224 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  37.71 
 
 
237 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  36.42 
 
 
237 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  36.42 
 
 
237 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.87 
 
 
225 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  36.42 
 
 
237 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  36.63 
 
 
227 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  38.69 
 
 
227 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.44 
 
 
413 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.64 
 
 
429 aa  101  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  39.33 
 
 
224 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.11 
 
 
196 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.69 
 
 
212 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  40.11 
 
 
215 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.88 
 
 
450 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.11 
 
 
224 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  38.79 
 
 
203 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  38.89 
 
 
222 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.49 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.45 
 
 
219 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 
187 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  40.7 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.15 
 
 
232 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.15 
 
 
232 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  34.85 
 
 
232 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  39.46 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.26 
 
 
232 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.18 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.12 
 
 
428 aa  97.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  35.8 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  36.93 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  36.02 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.93 
 
 
232 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  36.31 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  35.03 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  37.91 
 
 
224 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  38.46 
 
 
227 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.64 
 
 
229 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  33.95 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.35 
 
 
437 aa  94.4  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  38.38 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.6 
 
 
232 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.87 
 
 
221 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  36.55 
 
 
231 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.71 
 
 
234 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  36.05 
 
 
234 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.05 
 
 
428 aa  91.3  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.15 
 
 
429 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  40 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.04 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  32.46 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.55 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  39.41 
 
 
219 aa  89  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>