More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3497 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  73.33 
 
 		 213 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  61.84 
 
 		 215 aa  250  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  53.12 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.5 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  49.25 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  47.83 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  49.25 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  50.52 
 
 		 223 aa  184  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  48.1 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  45.55 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  44.23 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  48.24 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  43.32 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.15 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  41.95 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  48.02 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.55 
 
 		 237 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  47.31 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  43.41 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  40.91 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.13 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.66 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.16 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.76 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  46.47 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.7 
 
 		 450 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.79 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.49 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.5 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.15 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  50.67 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.26 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  37.89 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.79 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.79 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  42.11 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  38.02 
 
 		 212 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.27 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.79 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.26 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.26 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.59 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.18 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.21 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  35.08 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  40.78 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  35.08 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  47.4 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.54 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.39 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  47.4 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  34.97 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  34.03 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  38.83 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.75 
 
 		 232 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.59 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.16 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  35.57 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  37.74 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.36 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  36.11 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  36.2 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.58 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.31 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  33.7 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  32.37 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.54 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  32.64 
 
 		 237 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  32.64 
 
 		 237 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  32.64 
 
 		 237 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  33.52 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  35.08 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.68 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.68 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  35.6 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.83 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  33.7 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.5 
 
 		 428 aa  101  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.19 
 
 		 437 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.66 
 
 		 438 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.64 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  33.83 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  33.18 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  32.28 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  32.13 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.03 
 
 		 413 aa  99.4  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  35.11 
 
 		 545 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.01 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.66 
 
 		 438 aa  98.6  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  33.5 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.06 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1435  dimethylmenaquinone methyltransferase  47.83 
 
 		 116 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.66 
 
 		 438 aa  95.9  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.98 
 
 		 429 aa  95.5  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  35.24 
 
 		 529 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>