More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3023 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  83.9 
 
 		 267 aa  458  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  48.54 
 
 		 248 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  47.7 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  39.92 
 
 		 244 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  34.73 
 
 		 529 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  34.45 
 
 		 509 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  34.45 
 
 		 509 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  36.96 
 
 		 545 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  34.89 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  35.27 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  32.63 
 
 		 489 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  33.77 
 
 		 505 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  35.86 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  35.86 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  35.81 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  33.88 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  34.06 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  33.9 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  34.93 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  35.34 
 
 		 238 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  35.74 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.9 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  33.19 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  33.19 
 
 		 240 aa  119  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  31.38 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  32.62 
 
 		 237 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  31.38 
 
 		 532 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  33.04 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  31.88 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  31.76 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  32.34 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  36.64 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  31.67 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  32.64 
 
 		 241 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  31.06 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  31.06 
 
 		 241 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  31.72 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  30.77 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  31.84 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  33.9 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  32.91 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  32.13 
 
 		 227 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  33.94 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  29.11 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  34.13 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  37.05 
 
 		 508 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  31.33 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  32.63 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  31.76 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.65 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  31.3 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  32.77 
 
 		 237 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  32.77 
 
 		 237 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  32.77 
 
 		 237 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  28.69 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  32.05 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  29.18 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.9 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  34.36 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  30.85 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  29.3 
 
 		 228 aa  95.9  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  30.32 
 
 		 234 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  31.19 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.36 
 
 		 429 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.7 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  31.36 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.49 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.32 
 
 		 231 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  28.96 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  29.79 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.23 
 
 		 232 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  30.32 
 
 		 231 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  31.34 
 
 		 227 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 		 206 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.92 
 
 		 237 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.81 
 
 		 187 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.03 
 
 		 231 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  29.1 
 
 		 281 aa  89.4  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  29.72 
 
 		 233 aa  89.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  40 
 
 		 238 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.62 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6068  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  30.35 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  30.41 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.88 
 
 		 209 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  29.86 
 
 		 215 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.52 
 
 		 450 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.66 
 
 		 224 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6461  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  30.92 
 
 		 304 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.870184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.73 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.19 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.82 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.78 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.79 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  34.24 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  28.64 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.39 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.22 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>