252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2637 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  97.05 
 
 		 237 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  93.22 
 
 		 237 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  89.66 
 
 		 232 aa  427  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  88.41 
 
 		 234 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  78.88 
 
 		 232 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  76.29 
 
 		 239 aa  363  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  77.97 
 
 		 240 aa  352  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  77.23 
 
 		 237 aa  338  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  74.06 
 
 		 240 aa  329  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  74.06 
 
 		 240 aa  329  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  72.65 
 
 		 239 aa  328  6e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  75.85 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  78.48 
 
 		 233 aa  316  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  71.37 
 
 		 240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  71.01 
 
 		 236 aa  302  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  69.43 
 
 		 234 aa  295  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  68.12 
 
 		 233 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  44.07 
 
 		 244 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  45.3 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  39.92 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  45.45 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  38.56 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  41.59 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  39.08 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  38.66 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  38.4 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  40.34 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  37.55 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  36.89 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  37.86 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  42.54 
 
 		 258 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  37.28 
 
 		 239 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  36.13 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  41.35 
 
 		 505 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  41.41 
 
 		 489 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  35.59 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  36.64 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  37.93 
 
 		 532 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  34.45 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  36.77 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  38.79 
 
 		 509 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  38.79 
 
 		 509 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  40 
 
 		 545 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  39.65 
 
 		 529 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  44.3 
 
 		 508 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  32.76 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  32.17 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  31.76 
 
 		 275 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  29.57 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2742  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.3 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  30.43 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  30.59 
 
 		 281 aa  86.3  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  27.14 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.1 
 
 		 615 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  30.28 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.79 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.66 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.37 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.24 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  28.76 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  28.64 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.67 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.16 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.52 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.17 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.14 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  29.44 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.3 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  26.5 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.1 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.69 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  28.18 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  28.84 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  28.17 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  30.4 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  30 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  35.07 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.17 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.68 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  27.85 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.12 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.36 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  35.07 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.13 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.2 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  30.11 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  29.27 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.78 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  26.41 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.06 
 
 		 438 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  29.89 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.52 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  30.68 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.06 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  24.3 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  24.3 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  24.3 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>