More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5272 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  78.39 
 
 		 238 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  80.09 
 
 		 238 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  72.88 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  75.21 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  72.46 
 
 		 241 aa  363  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  71.97 
 
 		 239 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  68.2 
 
 		 239 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  69.49 
 
 		 237 aa  334  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  67.37 
 
 		 236 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  63.14 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  64.41 
 
 		 241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  62.29 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  66.53 
 
 		 236 aa  307  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  61.86 
 
 		 241 aa  304  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  61.7 
 
 		 252 aa  291  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  51.32 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  47.66 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  48.73 
 
 		 238 aa  225  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  51.67 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  45.54 
 
 		 545 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  38.3 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  42.08 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  41.59 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  41.59 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  40.71 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  41.41 
 
 		 239 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  41.86 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  39.38 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  39.73 
 
 		 505 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  40.39 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  41.33 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  37.39 
 
 		 489 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  38.77 
 
 		 509 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  38.36 
 
 		 529 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  38.77 
 
 		 509 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  40.7 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  40.2 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  38.43 
 
 		 238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  40.72 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  38.79 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  38.79 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  38.36 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  35.47 
 
 		 532 aa  139  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  36.48 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  35.62 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  33.61 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  40.09 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  31.38 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  37.56 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  39.09 
 
 		 508 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  33.17 
 
 		 281 aa  95.9  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.11 
 
 		 427 aa  94.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.93 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.63 
 
 		 428 aa  89.4  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  32.27 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.49 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2742  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.94 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.43 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  31.94 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.95 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.02 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.25 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.14 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.48 
 
 		 438 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.51 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.9 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  30.82 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.24 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  29.67 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.19 
 
 		 426 aa  78.6  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  31.65 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.09 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  29.05 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  31.6 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.96 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.52 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.57 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  29.41 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  29.41 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  29.17 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  29.95 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.07 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6067  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  26.64 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.677191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  28.44 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  29.41 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  31.64 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.77 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.67 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.96 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  27.48 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  27.48 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  27.48 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.86 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.44 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  29.17 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  31.28 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  31.75 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.01 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>