272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0198 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  75.42 
 
 
239 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  74.15 
 
 
236 aa  360  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  74.58 
 
 
239 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  75 
 
 
236 aa  357  7e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  72.03 
 
 
238 aa  345  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  71.19 
 
 
238 aa  342  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  69.49 
 
 
239 aa  334  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  68.35 
 
 
241 aa  332  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  66.67 
 
 
241 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  67.8 
 
 
241 aa  331  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  66.53 
 
 
241 aa  328  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  67.09 
 
 
241 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  66.53 
 
 
236 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  65.25 
 
 
236 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  60.17 
 
 
252 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  49.12 
 
 
244 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  50 
 
 
238 aa  221  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  46.12 
 
 
240 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  50 
 
 
239 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  39.92 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  39.92 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  39.06 
 
 
234 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  39.58 
 
 
237 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  42.29 
 
 
240 aa  164  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  42.38 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  40.08 
 
 
505 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  45.28 
 
 
545 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  39.25 
 
 
240 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  39.25 
 
 
240 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  41.2 
 
 
237 aa  158  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  40.09 
 
 
239 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  37.29 
 
 
232 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  41.52 
 
 
529 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  41.52 
 
 
509 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  41.52 
 
 
509 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  40.68 
 
 
239 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  38.89 
 
 
489 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  39.41 
 
 
232 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  38.1 
 
 
238 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  40.26 
 
 
240 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  40.1 
 
 
234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  38.65 
 
 
233 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  36.64 
 
 
532 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  36.96 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  40 
 
 
233 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  41.88 
 
 
508 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  38.17 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  31.82 
 
 
247 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  31.62 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  33.82 
 
 
281 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.85 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  30.14 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.66 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.49 
 
 
413 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  32.09 
 
 
233 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.16 
 
 
206 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.24 
 
 
427 aa  87.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  29.03 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2742  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.16 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  31.63 
 
 
235 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  32.23 
 
 
224 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.06 
 
 
205 aa  85.1  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.8 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.02 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.02 
 
 
438 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.92 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6067  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  28.57 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.677191  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  32.43 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.91 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.28 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.53 
 
 
438 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  29.74 
 
 
227 aa  82  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.77 
 
 
231 aa  82  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39280  predicted protein  35.82 
 
 
140 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.632179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.62 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.71 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  32.89 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.84 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.32 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.24 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  32.57 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  32.52 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.06 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.55 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  30.35 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.43 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.84 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.5 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6068  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  28.57 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.36 
 
 
437 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.17 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  29.38 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.36 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  31.39 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.27 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.95 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  30.99 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.3 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>