More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2595 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
214 aa  427  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  55.12 
 
 
207 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.31 
 
 
209 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  37.11 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.16 
 
 
232 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.51 
 
 
234 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.02 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  31.53 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.71 
 
 
230 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.32 
 
 
218 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3657  putative 4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase  36.32 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.86 
 
 
224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.62 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.07 
 
 
224 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.37 
 
 
221 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.94 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.21 
 
 
229 aa  98.6  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.24 
 
 
231 aa  95.9  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.08 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  34.52 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.84 
 
 
230 aa  93.2  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  32.49 
 
 
224 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.89 
 
 
225 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  33.75 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.48 
 
 
428 aa  92.4  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  33.91 
 
 
224 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  33.55 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  29.8 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.62 
 
 
429 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  31.02 
 
 
229 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  28.57 
 
 
225 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.49 
 
 
428 aa  89  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.98 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.67 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  32.95 
 
 
235 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  32.5 
 
 
231 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  34.01 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.53 
 
 
438 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.06 
 
 
426 aa  86.3  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  33.53 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.69 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.14 
 
 
437 aa  85.9  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.94 
 
 
428 aa  85.9  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5503  demethylmenaquinone methyltransferase protein  36.22 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  normal  0.409875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.67 
 
 
413 aa  85.1  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  34.38 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  30.48 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  31.88 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  40.44 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2467  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.18 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  34.59 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.93 
 
 
438 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.43 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  35.4 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.33 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  32.08 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  35.79 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  33.12 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.53 
 
 
438 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.18 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.92 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  37.76 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.04 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  33.33 
 
 
615 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  37.04 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  33.73 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  30.11 
 
 
615 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.35 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  31.25 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.13 
 
 
236 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  30.22 
 
 
244 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.96 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.51 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.17 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  26.32 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  33.99 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.51 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.51 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.25 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.76 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.78 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.83 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  30.63 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.25 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.53 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  33.78 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.72 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  31.91 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.57 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.51 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  33.8 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  33.8 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.64 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  33.8 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.83 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.58 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  32.31 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.8 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.76 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>