More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1073 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  43.69 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.5 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.38 
 
 
232 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.91 
 
 
230 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.45 
 
 
217 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  38.99 
 
 
217 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.14 
 
 
224 aa  131  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.32 
 
 
234 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 
224 aa  118  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.71 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.11 
 
 
209 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.44 
 
 
213 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5503  demethylmenaquinone methyltransferase protein  44.94 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  normal  0.409875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2467  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.39 
 
 
238 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3657  putative 4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase  43.86 
 
 
218 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.53 
 
 
218 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.94 
 
 
450 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.94 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.13 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  37.95 
 
 
216 aa  95.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.16 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  36 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.12 
 
 
205 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.31 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.94 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.64 
 
 
225 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 
212 aa  89  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.81 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.13 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.86 
 
 
204 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.12 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  41.22 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.73 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.94 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  36.18 
 
 
225 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.58 
 
 
187 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  40 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.71 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.94 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.6 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  33.71 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.6 
 
 
232 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  34.12 
 
 
213 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.6 
 
 
232 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.6 
 
 
232 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  35.15 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.16 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.99 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.61 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.03 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.01 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  36.36 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.48 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.88 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.72 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  33.77 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.72 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  31.77 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.04 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  37.88 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.29 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.59 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  37.8 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.64 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.64 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  32.14 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.07 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  32.14 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  32.14 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  34.44 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  29.46 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  37.08 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  31.48 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.84 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  30.51 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  31.03 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  36.64 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.94 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  29.68 
 
 
228 aa  72  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  32.24 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  34.78 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  36.46 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  34.4 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.03 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  33.12 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.6 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  36.28 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  32.89 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  32.54 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.54 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.3 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  28.76 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  32.62 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.91 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.52 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  34.15 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  32.24 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>