246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4783 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  71.23 
 
 		 220 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  52.38 
 
 		 222 aa  201  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.05 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  38.65 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.29 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03178  putative transferase protein  36.45 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442727  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.09 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.51 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.63 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  36.26 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.75 
 
 		 192 aa  88.2  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.64 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.46 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.16 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.73 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.65 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  27.59 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  30.65 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.18 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.94 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.21 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  29.19 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.38 
 
 		 428 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  25.73 
 
 		 615 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.76 
 
 		 429 aa  75.9  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.64 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  33.51 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03177  putative transferase protein  31.05 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  25.13 
 
 		 615 aa  75.5  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.14 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.5 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.82 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  34.93 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.22 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.89 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.86 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.8 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.81 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.65 
 
 		 437 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26 
 
 		 426 aa  71.6  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.52 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  26.82 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.49 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.37 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01570  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279438  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.25 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  28.43 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.07 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  30.15 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.14 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  28.29 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  32.35 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.35 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.05 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25 
 
 		 438 aa  68.6  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  34.73 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.88 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.68 
 
 		 428 aa  68.2  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  31.55 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  28.48 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  25.53 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  31.38 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.99 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25 
 
 		 438 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.35 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  36.18 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.27 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  32.06 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.68 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.99 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.46 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.64 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.98 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.06 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.06 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.49 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  30.99 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  29.82 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  27.81 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  35.78 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29980  predicted protein  26.75 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.650262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  31.58 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.21 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  28.87 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  29.82 
 
 		 509 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  28.95 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  29.82 
 
 		 509 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.78 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  29.03 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  32.87 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  27.5 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.24 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  31.82 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  33.13 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>