More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_4017 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  56.25 
 
 		 216 aa  222  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  53.11 
 
 		 220 aa  207  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  52.58 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  47.24 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.37 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  40.38 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  36.99 
 
 		 615 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  37.16 
 
 		 615 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03177  putative transferase protein  43.72 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.29 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.25 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03178  putative transferase protein  37.25 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442727  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  33.49 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.51 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  30.56 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.85 
 
 		 428 aa  99  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.5 
 
 		 438 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33 
 
 		 438 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.48 
 
 		 437 aa  95.5  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.08 
 
 		 438 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  33.17 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.91 
 
 		 428 aa  92.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.63 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.57 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.28 
 
 		 428 aa  89.7  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  31.31 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  34.15 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.47 
 
 		 429 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.85 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.04 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.71 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  32.83 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.49 
 
 		 413 aa  85.9  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  30.39 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.84 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33 
 
 		 427 aa  84.7  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.05 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  33.01 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  34.94 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  31.34 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.91 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.39 
 
 		 426 aa  82.8  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  30.81 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.65 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.14 
 
 		 429 aa  81.6  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  33.73 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  34.5 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  35.38 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  31.71 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.85 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  31.66 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  31.35 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  35.79 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  34.25 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.3 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  29.27 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.75 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.79 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  32.12 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.52 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  31.82 
 
 		 545 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  33.15 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01570  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  32.86 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.76 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.85 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  30.05 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  32.14 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.33 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  31.38 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.84 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  30.77 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  32.54 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  32 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.18 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.17 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  30.05 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.76 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  29.79 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.15 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  33.7 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  28.51 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  32.37 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  30.16 
 
 		 238 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.43 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  30.5 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  29.39 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  32.43 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.67 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  31.84 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  28.95 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  28.7 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.67 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  31.84 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  31.95 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  29.61 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>