270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1080 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  46.8 
 
 		 222 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.36 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  38.05 
 
 		 615 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  37.62 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  38.05 
 
 		 615 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.22 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.12 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.29 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.89 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03177  putative transferase protein  44.5 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  35.9 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.85 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  36.32 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.35 
 
 		 428 aa  93.2  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.73 
 
 		 429 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.71 
 
 		 428 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.68 
 
 		 426 aa  84.7  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.69 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.43 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.92 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.37 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.46 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.87 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.99 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.43 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  35.05 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.38 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  32.34 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.43 
 
 		 429 aa  78.6  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.65 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  32.99 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.54 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  37.04 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.27 
 
 		 438 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  31.37 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  32.74 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.66 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  27.18 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.88 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.82 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.83 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3295  demethylmenaquinone methyltransferase  32.7 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.33 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  32.34 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  30.41 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  30.39 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  33.67 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  30.85 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  30.65 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  32.12 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  32.12 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  31.61 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.14 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.1 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  28.71 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.43 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.16 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.59 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.05 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5088  demethylmenaquinone methyltransferase  29.76 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  29.82 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  31.55 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  32.12 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  34.71 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  30.81 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  30.81 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.08 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.74 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.39 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  30.85 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  32.84 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  34.96 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  29.73 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  34.2 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.51 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  30.65 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  29.22 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1223  ribonuclease activity regulator protein RraA  38.04 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  29.5 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.15 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  30.6 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  32.16 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.14 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  30.54 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  34.65 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.64 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.95 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  31.53 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  32.84 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  29.8 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  31.4 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  30.62 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.54 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.76 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.75 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  30.11 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.5 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>