264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3295 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3295  demethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5088  demethylmenaquinone methyltransferase  55.17 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  35.75 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  38.46 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  33.17 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  31.31 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  31.68 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  31.66 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.37 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.08 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.29 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.71 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  32.56 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.56 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  34.13 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  35.9 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  34.97 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  37.33 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.7 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.39 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.91 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.89 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.5 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.18 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.36 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.94 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  35.62 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.59 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  35.62 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  35.62 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  31.54 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.79 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3657  putative 4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase  35.56 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.56 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.8 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.46 
 
 		 438 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39280  predicted protein  34.96 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.632179 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.51 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.72 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  31.52 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.59 
 
 		 196 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.77 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.53 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  30.95 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  29.03 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.1 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.02 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.76 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  36.25 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  34.35 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.15 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.34 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.25 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.58 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  29.47 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.41 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.33 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.26 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  28.72 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.67 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.9 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  35.04 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.88 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  32.64 
 
 		 615 aa  62.4  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.5 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.22 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  30.52 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  35.56 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  29.49 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  31.94 
 
 		 615 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  31.43 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.87 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.22 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.58 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  30.09 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.53 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.84 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.67 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.75 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.76 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.24 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  31.16 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.01 
 
 		 426 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.25 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  31.45 
 
 		 505 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  30.34 
 
 		 532 aa  58.5  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  34.07 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.71 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.37 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.82 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.63 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.84 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  29.63 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  29.55 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  26.84 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  32.37 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.81 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>