284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0626 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  100 
 
 
246 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  42.4 
 
 
221 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.06 
 
 
209 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.85 
 
 
204 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  30.33 
 
 
615 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.82 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.93 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.12 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  33.82 
 
 
216 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.81 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7865  predicted protein  34.13 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.50782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.46 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.54 
 
 
196 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.79 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  29.38 
 
 
615 aa  78.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.91 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.21 
 
 
426 aa  77  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.81 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.26 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.23 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.1 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.39 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.55 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.95 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  30.22 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.56 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.81 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  34.38 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.13 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.38 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  28.77 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  34.01 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.43 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  28.43 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  38.64 
 
 
229 aa  72  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  28.82 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.11 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  39.6 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  27.12 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  32.89 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.96 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.11 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.22 
 
 
205 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  31.43 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  28.5 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.51 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  33.8 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.25 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  34.17 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  32.2 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.68 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.79 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  26.61 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  26.61 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  26.61 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.91 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.37 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.03 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.18 
 
 
438 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  37.38 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.62 
 
 
438 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.64 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.99 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.47 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.97 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.03 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.38 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.94 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  32.35 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  26.44 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  29.67 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  32.65 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  31.39 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.18 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.99 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.46 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  33.09 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  25.25 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.17 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  27.67 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.76 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  25.96 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  29.35 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.76 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.76 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  34.34 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  25.51 
 
 
439 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.56 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  27.67 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.73 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  26.44 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3295  demethylmenaquinone methyltransferase  29.47 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.38 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.53 
 
 
413 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  28.81 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  37.5 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.24 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  29.59 
 
 
281 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  31.47 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>