256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1063 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.97 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  36.19 
 
 
224 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  34.17 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.95 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  31.25 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.28 
 
 
450 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  31.52 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.18 
 
 
196 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.91 
 
 
234 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  29.15 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.55 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  32.02 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  33 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.69 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  33.64 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  33.18 
 
 
222 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.66 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.69 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  31.55 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.83 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.88 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  28.64 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.53 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.84 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.65 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.55 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03178  putative transferase protein  32.51 
 
 
233 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442727  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.64 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.81 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.86 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.27 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.37 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.66 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  30.54 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  31.32 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.96 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.61 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  31.1 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  29.78 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.88 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  27.57 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.53 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.37 
 
 
438 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.25 
 
 
429 aa  75.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.1 
 
 
428 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.18 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  29.44 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.76 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  27.36 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.3 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  30.3 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  30.89 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  32.51 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  30.1 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.84 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  29.2 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.09 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  27.88 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.51 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  32.37 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  26.87 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.25 
 
 
428 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.06 
 
 
413 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  29.08 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  29.23 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01570  conserved hypothetical protein  32.19 
 
 
229 aa  72  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279438  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.06 
 
 
230 aa  72  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.1 
 
 
236 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.29 
 
 
223 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  27.8 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.63 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  30.86 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  34.86 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  27.56 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  25.85 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  32.2 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  29.59 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  34.86 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.93 
 
 
615 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  26.77 
 
 
615 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.12 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.35 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  32.56 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  26.54 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  28.78 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.19 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  28.17 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  33.78 
 
 
509 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  33.78 
 
 
509 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  28.29 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  33.78 
 
 
529 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  35 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  27.68 
 
 
532 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  33.14 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>