229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5774 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 220 aa  433  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  71.23 
 
 		 220 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  51.63 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.81 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  41.35 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03178  putative transferase protein  37.44 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442727  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.16 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.63 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  33.53 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  24.64 
 
 		 615 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.86 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  24.07 
 
 		 615 aa  84.7  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.37 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.92 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.06 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.22 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.57 
 
 		 429 aa  78.2  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  30.61 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.19 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.44 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  28.9 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.73 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.5 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  30.23 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.43 
 
 		 264 aa  72  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.05 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.78 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.4 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.77 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.65 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.73 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.05 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.1 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  31.91 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  30.39 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.87 
 
 		 437 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.59 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  32.41 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.62 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  29.33 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.23 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  36.19 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.33 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.89 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  24.04 
 
 		 438 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  27.6 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  34.06 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.44 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  28.57 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  31.72 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.75 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03177  putative transferase protein  29.94 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  32.59 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  27.47 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  27.8 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.79 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.26 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.02 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  28.28 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  24.15 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.14 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  27.07 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  24.15 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  28.57 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.03 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  30.67 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.05 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29980  predicted protein  26.32 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.650262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.94 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  27.59 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.17 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  30.13 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01570  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279438  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  30.17 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.86 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7865  predicted protein  30.08 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.50782  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.65 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  25.25 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.36 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.71 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.44 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.16 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  26.04 
 
 		 439 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  31.86 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.86 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  28 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  29.07 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.12 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.34 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  25.6 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.36 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  31.62 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3716  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.83 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.291445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.89 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.37 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  29.28 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>