More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0479 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2467  dimethylmenaquinone methyltransferase  58.93 
 
 		 238 aa  248  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.47 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  39.73 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.73 
 
 		 217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.44 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.73 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  38.64 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.44 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.24 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.18 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.32 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.82 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.32 
 
 		 213 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.51 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.39 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.75 
 
 		 428 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.5 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  34.87 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  40.14 
 
 		 429 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.15 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3657  putative 4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase  38.22 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  39.74 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.22 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  34.74 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.3 
 
 		 232 aa  99.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.91 
 
 		 450 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5503  demethylmenaquinone methyltransferase protein  37.37 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  normal  0.409875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  33.33 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.17 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.81 
 
 		 426 aa  96.3  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.97 
 
 		 413 aa  95.5  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  38.06 
 
 		 428 aa  94.7  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.93 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.12 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  40.6 
 
 		 429 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  32.8 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.21 
 
 		 438 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  32.8 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.2 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  32.8 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  32.94 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.92 
 
 		 438 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.06 
 
 		 437 aa  92.8  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  35.8 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  32.7 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  32.82 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.14 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.01 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  32.14 
 
 		 246 aa  91.7  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.92 
 
 		 438 aa  91.7  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.12 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.22 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  37.13 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.33 
 
 		 427 aa  89.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.77 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  34 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  35.26 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.21 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  31.37 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.79 
 
 		 198 aa  88.6  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  35.42 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  34.12 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  34.04 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.76 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  31.61 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  33.91 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.43 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.54 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.26 
 
 		 428 aa  85.5  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.16 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.74 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  32.93 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.11 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.32 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.3 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  38.1 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  33.75 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.04 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.78 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.86 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.38 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  32.87 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.87 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  36.17 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  32.28 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  32.69 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  33.96 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  31.67 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  31.11 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.52 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.17 
 
 		 615 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  27.72 
 
 		 615 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.92 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>