272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5092 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
215 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  33.33 
 
 
615 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  33.81 
 
 
615 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  36.98 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.7 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.96 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.12 
 
 
234 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.33 
 
 
438 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.64 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.24 
 
 
225 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  33.01 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.39 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.85 
 
 
239 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.31 
 
 
438 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.5 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  32.23 
 
 
275 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  32.86 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.45 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.28 
 
 
438 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  36.78 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  33.67 
 
 
228 aa  85.1  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.42 
 
 
428 aa  85.1  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.88 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.56 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.17 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  31.44 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.98 
 
 
437 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  33.97 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  34.16 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01570  conserved hypothetical protein  35.82 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279438  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  39.76 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.51 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.78 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  32.72 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.8 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  34.95 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.29 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.3 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.43 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.92 
 
 
229 aa  79  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.62 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.68 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.29 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.16 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.24 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.51 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.33 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.46 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.69 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  32.26 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  32.26 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  33.93 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.66 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  32.26 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.36 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.31 
 
 
428 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.32 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  30 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.47 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.35 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  33 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.34 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  30.99 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.26 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.42 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.18 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  35.14 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  31.66 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  31.16 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.17 
 
 
450 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  30.48 
 
 
267 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.7 
 
 
196 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.07 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  31.25 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  32.18 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  29.95 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  29.21 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  30.34 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  29.74 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  30.84 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.07 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.91 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  31.12 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.15 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.48 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.73 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  30 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  29.21 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  34.02 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  29.53 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.35 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.8 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  28.65 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  29.29 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  29.59 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.2 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>