More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9409 on replicon NC_013596
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.15 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.28 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  43.3 
 
 		 216 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.05 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.93 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.04 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  39.39 
 
 		 224 aa  127  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.57 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  40.93 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.11 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  38.86 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  37.82 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  37.31 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  41.46 
 
 		 224 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.57 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.23 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.86 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.53 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  36.92 
 
 		 233 aa  111  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  38.74 
 
 		 227 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  37.95 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  45.22 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  39.02 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  38.74 
 
 		 234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.02 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  31.98 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.92 
 
 		 450 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.87 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.82 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.08 
 
 		 229 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  36.9 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  34.76 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  33.68 
 
 		 246 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  38.54 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.88 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  31.46 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  36.6 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.83 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.69 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  38.86 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  38.54 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  34.95 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.56 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.29 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.84 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  33.88 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.06 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  40 
 
 		 224 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  37.23 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.43 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1421  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.43 
 
 		 259 aa  98.6  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  37.43 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.18 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  37.1 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  37.82 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.27 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.88 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.79 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.92 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.71 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  33.51 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  36.09 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.32 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.32 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  34.39 
 
 		 238 aa  92.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.87 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.6 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  36.84 
 
 		 227 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.02 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.02 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  35.6 
 
 		 244 aa  91.7  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  34.92 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  34.92 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  34.92 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4375  hypothetical protein  40.54 
 
 		 230 aa  91.3  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.54 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.06 
 
 		 233 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 232 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.57 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.31 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  30.32 
 
 		 221 aa  89  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.46 
 
 		 232 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  34.85 
 
 		 246 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.55 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.67 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  36.55 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.36 
 
 		 232 aa  87.8  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.36 
 
 		 228 aa  87.8  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3942  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  37.31 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.53 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.36 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.86 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.36 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.3 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.26 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.06 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>