More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3877 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  39.06 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.04 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.02 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  37.5 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  36.17 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.98 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.6 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.18 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3657  putative 4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase  39.9 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.18 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.55 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.92 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.12 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.5 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.64 
 
 		 428 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.98 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  40.26 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  36.96 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  37.57 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.46 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  40 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.02 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  40.26 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.06 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.86 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.16 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.18 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.98 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.6 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.61 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  38.31 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.55 
 
 		 450 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  37.66 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.59 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.78 
 
 		 429 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.59 
 
 		 427 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  41.14 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  43.65 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.4 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.18 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.68 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  30.81 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  35.17 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  39.24 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.91 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.87 
 
 		 429 aa  97.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.26 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  33.77 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  31.95 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.17 
 
 		 203 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.95 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  33.14 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.54 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  35.81 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.32 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  29.57 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.33 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  32.04 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.18 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  28.42 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.38 
 
 		 428 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.4 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.85 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.95 
 
 		 428 aa  92  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  31.82 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  32.35 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.54 
 
 		 413 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.5 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.14 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2467  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.58 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  31.52 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  31.52 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  30.23 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  31.52 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  29.65 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.16 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  29.47 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  28.11 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  31.1 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.14 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  29.28 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  33.73 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  25.87 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.8 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  29.09 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.59 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.16 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.3 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  26.86 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.1 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  28.65 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.91 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  31.43 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>