More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6038 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  94.71 
 
 
227 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  76.21 
 
 
227 aa  328  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  71.37 
 
 
231 aa  328  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  70.04 
 
 
229 aa  328  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  73.57 
 
 
227 aa  325  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6374  hypothetical protein  79.74 
 
 
227 aa  322  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0543151  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  70.04 
 
 
234 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  71.37 
 
 
227 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  73.57 
 
 
231 aa  313  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  71.81 
 
 
227 aa  308  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  70.04 
 
 
235 aa  307  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  74.01 
 
 
231 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  66.96 
 
 
227 aa  302  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  64.86 
 
 
246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0876  hypothetical protein  75.77 
 
 
231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41177  normal  0.375435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  59.47 
 
 
233 aa  263  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  58.3 
 
 
237 aa  261  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  55.95 
 
 
237 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  55.95 
 
 
237 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  55.95 
 
 
237 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4205  hypothetical protein  66.22 
 
 
237 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  59.03 
 
 
238 aa  255  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  57.47 
 
 
224 aa  248  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  63.18 
 
 
219 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  57.4 
 
 
244 aa  238  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  55.14 
 
 
228 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1361  hypothetical protein  56.71 
 
 
238 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4375  hypothetical protein  57.27 
 
 
230 aa  230  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  55.95 
 
 
238 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  55.95 
 
 
238 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  54.63 
 
 
238 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3942  hypothetical protein  56.56 
 
 
225 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.22 
 
 
230 aa  190  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.93 
 
 
212 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.23 
 
 
198 aa  141  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.81 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  41 
 
 
211 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.54 
 
 
216 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  38.73 
 
 
216 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.47 
 
 
224 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.48 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  36.41 
 
 
224 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.65 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.15 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.21 
 
 
208 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.94 
 
 
225 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.57 
 
 
187 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.63 
 
 
231 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  37.32 
 
 
222 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.56 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  30.32 
 
 
225 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.89 
 
 
220 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  30.85 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.54 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.59 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.21 
 
 
450 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  31.65 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  40.59 
 
 
224 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  32.86 
 
 
248 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  36.36 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  32.34 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  32.69 
 
 
224 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  31.92 
 
 
247 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.67 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.31 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  37.42 
 
 
215 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.66 
 
 
208 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  30.28 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.55 
 
 
219 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.97 
 
 
236 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.64 
 
 
237 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.86 
 
 
231 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  32.2 
 
 
224 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.79 
 
 
209 aa  104  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.31 
 
 
232 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.31 
 
 
232 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  29 
 
 
212 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.73 
 
 
232 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.71 
 
 
232 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.71 
 
 
232 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  35.03 
 
 
223 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.21 
 
 
196 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  32.81 
 
 
213 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.65 
 
 
229 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.88 
 
 
236 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.84 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  30.41 
 
 
275 aa  99  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.15 
 
 
221 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.62 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.75 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.36 
 
 
203 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  28.72 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.62 
 
 
232 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.16 
 
 
429 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.88 
 
 
428 aa  97.1  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.9 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.7 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.87 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  39.85 
 
 
267 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>