More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2027 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  96.22 
 
 		 238 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  95.8 
 
 		 238 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  74.36 
 
 		 237 aa  363  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  78.9 
 
 		 238 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1361  hypothetical protein  80.67 
 
 		 238 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  71 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  65.38 
 
 		 237 aa  307  9e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  65.38 
 
 		 237 aa  307  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  65.38 
 
 		 237 aa  307  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  60.99 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  59.64 
 
 		 228 aa  268  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3942  hypothetical protein  59.38 
 
 		 225 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  54.19 
 
 		 229 aa  255  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  53.68 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  58.74 
 
 		 227 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  57.85 
 
 		 227 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  56.95 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  54.63 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  54.63 
 
 		 227 aa  241  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  59.22 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  63.64 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  54.63 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  53.07 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4205  hypothetical protein  59.29 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  54.75 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  54.98 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  53.07 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  53.36 
 
 		 227 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  55.16 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6374  hypothetical protein  56.5 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0543151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0876  hypothetical protein  55.61 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41177  normal  0.375435 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4375  hypothetical protein  52.63 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  48.02 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.46 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  41.55 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.49 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.54 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.94 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  39.05 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.65 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.94 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.43 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.69 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.5 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.41 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.76 
 
 		 450 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.84 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.1 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.1 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.48 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.39 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.36 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.02 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.56 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.56 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.91 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  31.61 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.81 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.86 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  30.85 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.13 
 
 		 187 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.86 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  35.56 
 
 		 222 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  34.42 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.64 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  32.82 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  32.65 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  41.71 
 
 		 203 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.5 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.29 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.52 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.18 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  31.31 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.84 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  32.56 
 
 		 247 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.32 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  31.89 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  29.74 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  33.53 
 
 		 212 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.76 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.54 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  32.98 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.37 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.24 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.33 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.87 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  36 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.99 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.67 
 
 		 196 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.5 
 
 		 206 aa  92.8  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.8 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  31.58 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.45 
 
 		 438 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.61 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  32.11 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>