More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0329 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  78.48 
 
 
237 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  76.47 
 
 
238 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  71 
 
 
238 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  72.29 
 
 
238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1361  hypothetical protein  69.92 
 
 
238 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  71.86 
 
 
238 aa  307  9e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  65.79 
 
 
237 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  65.79 
 
 
237 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  65.79 
 
 
237 aa  299  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  63.39 
 
 
246 aa  277  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  60.18 
 
 
228 aa  275  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3942  hypothetical protein  64.55 
 
 
225 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  61.43 
 
 
227 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  54.82 
 
 
229 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  57.85 
 
 
227 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  55.84 
 
 
231 aa  255  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  59.03 
 
 
227 aa  255  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  58.15 
 
 
227 aa  254  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  57.83 
 
 
235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  57.58 
 
 
231 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  57.85 
 
 
233 aa  247  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  57.4 
 
 
227 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  55.36 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  56.28 
 
 
231 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  56.5 
 
 
227 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  56.39 
 
 
227 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  62.56 
 
 
219 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4205  hypothetical protein  61.26 
 
 
237 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  55 
 
 
224 aa  238  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6374  hypothetical protein  56.95 
 
 
227 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0543151  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0876  hypothetical protein  57.14 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41177  normal  0.375435 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  49.78 
 
 
230 aa  208  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4375  hypothetical protein  55.26 
 
 
230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.47 
 
 
224 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  43.64 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.01 
 
 
224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.59 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.62 
 
 
229 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  42.36 
 
 
216 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.65 
 
 
212 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.35 
 
 
224 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.68 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.84 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.59 
 
 
208 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.6 
 
 
232 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.88 
 
 
187 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.56 
 
 
225 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.41 
 
 
198 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.39 
 
 
232 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.78 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  35.51 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  33 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  31.84 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  37.21 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.95 
 
 
450 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.1 
 
 
220 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  36.74 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.08 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.08 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.16 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  34.07 
 
 
225 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.38 
 
 
232 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.38 
 
 
232 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  37.28 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  34.01 
 
 
222 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.7 
 
 
232 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  35.47 
 
 
212 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.92 
 
 
229 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.26 
 
 
209 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.54 
 
 
219 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 
207 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.89 
 
 
205 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.6 
 
 
231 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.67 
 
 
232 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.67 
 
 
232 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.67 
 
 
232 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  31.69 
 
 
224 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.6 
 
 
204 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  35.5 
 
 
223 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  37.17 
 
 
203 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.84 
 
 
196 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.17 
 
 
232 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.04 
 
 
207 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.15 
 
 
225 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  34.34 
 
 
212 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  32 
 
 
224 aa  99  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.44 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  34.32 
 
 
224 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.65 
 
 
203 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.5 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.32 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.23 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  34.32 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.28 
 
 
232 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.43 
 
 
205 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  40 
 
 
275 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.42 
 
 
236 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.22 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.72 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>