More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31280 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  78.72 
 
 		 237 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  80.17 
 
 		 238 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  79.75 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  78.9 
 
 		 238 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  76.47 
 
 		 244 aa  342  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1361  hypothetical protein  74.68 
 
 		 238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  65.96 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  65.96 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  65.96 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  63.23 
 
 		 246 aa  279  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3942  hypothetical protein  64.29 
 
 		 225 aa  268  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  56.83 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  59.91 
 
 		 228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  60.99 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  60.99 
 
 		 227 aa  262  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  56.71 
 
 		 231 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  59.47 
 
 		 227 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  57.71 
 
 		 227 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  62.14 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  59.64 
 
 		 227 aa  255  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  59.03 
 
 		 227 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  56.58 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  64.86 
 
 		 219 aa  248  9e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  56.14 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4205  hypothetical protein  63.06 
 
 		 237 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  55.84 
 
 		 231 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  55.41 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  56.5 
 
 		 227 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6374  hypothetical protein  58.74 
 
 		 227 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0543151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  55.2 
 
 		 224 aa  234  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  52.89 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0876  hypothetical protein  55.41 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41177  normal  0.375435 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4375  hypothetical protein  56.14 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.08 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.49 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.49 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  40.18 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  40.58 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.76 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.49 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.32 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.75 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.31 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.45 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.24 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.41 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.38 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.55 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 		 450 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.38 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.96 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.96 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.55 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.84 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  33 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.18 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.18 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.21 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.09 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  33.68 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.21 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  31.68 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  33.68 
 
 		 212 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  34.01 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  35.35 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  34.88 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  33 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.97 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  36.42 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.06 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  36.65 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  30.57 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  31.22 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  27.98 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.69 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.03 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  36.6 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.86 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.6 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.53 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.25 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  32.77 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.72 
 
 		 231 aa  99  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  31 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.54 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.39 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.21 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  28.04 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.16 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  32.08 
 
 		 213 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.68 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  40.3 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.71 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.53 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  31.66 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>