More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2677 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 216 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  65.67 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  45.54 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  45.32 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  43.96 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  41.09 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  43.65 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  43.65 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  43.65 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  42.36 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  42 
 
 		 246 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.9 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  40.1 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  40.5 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  37.95 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  40.4 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  38.61 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  40.1 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  40.31 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  41.54 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  39.13 
 
 		 227 aa  137  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  45.54 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.67 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  41.46 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  45.18 
 
 		 238 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  45.18 
 
 		 238 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4205  hypothetical protein  40.69 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  37.68 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.69 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  41.03 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1361  hypothetical protein  42.16 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  41.29 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  39.38 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.7 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  36.14 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.66 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.86 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3942  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  43.81 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  42.11 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.11 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.5 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.38 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.77 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.67 
 
 		 450 aa  121  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4375  hypothetical protein  38.38 
 
 		 230 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  33 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6374  hypothetical protein  40.82 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0543151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  37.43 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.08 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.77 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  36 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.01 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.13 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.01 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.86 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.34 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.95 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.43 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.28 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.69 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.81 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  34.39 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.61 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.61 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.8 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0876  hypothetical protein  40.49 
 
 		 231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41177  normal  0.375435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.38 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.21 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.55 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.36 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.5 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.46 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.12 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.09 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  33.18 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.62 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.58 
 
 		 429 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.64 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  36.49 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.2 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  32.54 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.57 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.6 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  34.12 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  31.22 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  39.44 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.51 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  37.59 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  32.95 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.28 
 
 		 428 aa  93.6  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.27 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.72 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.48 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.99 
 
 		 196 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.44 
 
 		 413 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  38.03 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>