More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4706 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
232 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  94.4 
 
 
232 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  93.53 
 
 
232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  93.53 
 
 
232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  89.22 
 
 
232 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  81.9 
 
 
232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  81.9 
 
 
232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  68.97 
 
 
232 aa  320  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  71.55 
 
 
232 aa  308  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  61.99 
 
 
232 aa  258  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  55.02 
 
 
229 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  61.71 
 
 
228 aa  243  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  55.45 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  54.63 
 
 
229 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  44.44 
 
 
224 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.52 
 
 
233 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.94 
 
 
231 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 
225 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  38.32 
 
 
225 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  39.44 
 
 
224 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  39.44 
 
 
225 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 
229 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  41.01 
 
 
224 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.71 
 
 
236 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.7 
 
 
450 aa  148  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  43.78 
 
 
222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  42.38 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  40.93 
 
 
224 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  40.58 
 
 
222 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.22 
 
 
212 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  52.59 
 
 
203 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  52.59 
 
 
203 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.32 
 
 
211 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  43.03 
 
 
216 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  46.24 
 
 
213 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.23 
 
 
209 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  37.21 
 
 
224 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.75 
 
 
231 aa  135  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.87 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.9 
 
 
224 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  43.39 
 
 
215 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.99 
 
 
223 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  43.11 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  37.3 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.25 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  37.85 
 
 
212 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.91 
 
 
208 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.34 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.68 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.5 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  36.63 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.28 
 
 
237 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  34.34 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  34.34 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  34.34 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  32.83 
 
 
228 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  37.88 
 
 
224 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  35.78 
 
 
233 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  46 
 
 
227 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  37.06 
 
 
227 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.09 
 
 
225 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  42.63 
 
 
215 aa  121  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.66 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.64 
 
 
187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  34.38 
 
 
227 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  33.01 
 
 
231 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  118  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.44 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  35.19 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.11 
 
 
225 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  30.09 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.46 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.42 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  34.94 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.94 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  32.24 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.62 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  34.34 
 
 
231 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.23 
 
 
206 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  36.89 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  36.44 
 
 
238 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  36.44 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.28 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  31.93 
 
 
231 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 
207 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  31.16 
 
 
227 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.5 
 
 
224 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  33.53 
 
 
227 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  33.15 
 
 
244 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.36 
 
 
204 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.14 
 
 
205 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  32.57 
 
 
247 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3942  hypothetical protein  31.48 
 
 
225 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.57 
 
 
221 aa  101  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.7 
 
 
207 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  33.13 
 
 
227 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.84 
 
 
223 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4375  hypothetical protein  36.68 
 
 
230 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>