More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6784 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  63.51 
 
 		 215 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  73.98 
 
 		 215 aa  262  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  55.15 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  54.1 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  55.74 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  50 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  49 
 
 		 222 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  49.5 
 
 		 222 aa  187  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  44.12 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  45.03 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  41.18 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  48 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.05 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  41.71 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  43.94 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  44.74 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.61 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  39.9 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.23 
 
 		 237 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.49 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.11 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.58 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.26 
 
 		 225 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.45 
 
 		 450 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.57 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  36.32 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.98 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  43.79 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  38.2 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.53 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.45 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.37 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.21 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.24 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  54.05 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  54.05 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.91 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.75 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.29 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.91 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.91 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  47.06 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.42 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.5 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.07 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.38 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.54 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.7 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.9 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.16 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  46.41 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  30.69 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  37.28 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.31 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  32.61 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.04 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  36.79 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.16 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  37.01 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  31.52 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  32.07 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  32.29 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.91 
 
 		 232 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  34.02 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  32.7 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.51 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  32.81 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  29.89 
 
 		 229 aa  94.7  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.71 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  31.22 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  34.09 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  34.09 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.06 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  34.09 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.89 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  32.3 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.37 
 
 		 428 aa  90.9  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.55 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  33.15 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  33.72 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  32.54 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.04 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.65 
 
 		 428 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.93 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  29.13 
 
 		 489 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  31.28 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  30.94 
 
 		 505 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.89 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  29.65 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.05 
 
 		 428 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  33.01 
 
 		 509 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.44 
 
 		 429 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  33.01 
 
 		 529 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  33.01 
 
 		 509 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>