More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2467 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2467  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  58.93 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.28 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  41.28 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.83 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.52 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.83 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  38.25 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.15 
 
 		 209 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.1 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.31 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.39 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.45 
 
 		 218 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3657  putative 4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase  40.4 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5503  demethylmenaquinone methyltransferase protein  38.83 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  normal  0.409875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.66 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.6 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.58 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  34.81 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  35.71 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  33.33 
 
 		 216 aa  95.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.18 
 
 		 214 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.77 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.13 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.21 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  38.56 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.79 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.52 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.56 
 
 		 264 aa  85.1  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  31.18 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  37.25 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.81 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.21 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.74 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.36 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.61 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  31.43 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  27.04 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.68 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.36 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  30.11 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  27.55 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  33.12 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  33.12 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  33.12 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.75 
 
 		 428 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.97 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.71 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  29.74 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  28.72 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.6 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  29.69 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.06 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.71 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.26 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.72 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  31.45 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  32.92 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  29.13 
 
 		 532 aa  75.5  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.03 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.71 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  32.03 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  31.65 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.86 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  32.05 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  31.41 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  31.47 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  30.19 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  30.72 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.21 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  32.68 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  29.81 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  30.77 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  30.22 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  28.48 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.17 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  32.5 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.61 
 
 		 438 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.14 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.29 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.79 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.72 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.86 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.85 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  32.14 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.92 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.94 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  33.09 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  29.73 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4205  hypothetical protein  33.07 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.71 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  26.94 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  34.31 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0420602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>