More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7816 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
213 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  47.15 
 
 
230 aa  165  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.41 
 
 
217 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  44.9 
 
 
217 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  43.28 
 
 
221 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  47.4 
 
 
209 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.29 
 
 
221 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.78 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.5 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  44 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.32 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.12 
 
 
224 aa  118  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3657  putative 4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase  44 
 
 
218 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2467  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.31 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.44 
 
 
236 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.62 
 
 
214 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  35.47 
 
 
216 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5503  demethylmenaquinone methyltransferase protein  42.13 
 
 
217 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  normal  0.409875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.79 
 
 
207 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.21 
 
 
229 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.53 
 
 
413 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.83 
 
 
212 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 
232 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.12 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.77 
 
 
229 aa  95.5  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.97 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.73 
 
 
428 aa  94  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  37.08 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 
450 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.65 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.6 
 
 
204 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  35.58 
 
 
224 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  37.3 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.58 
 
 
429 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.38 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.88 
 
 
428 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.94 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.62 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.25 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.57 
 
 
198 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.97 
 
 
438 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30 
 
 
437 aa  86.3  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.35 
 
 
438 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  29.84 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.81 
 
 
219 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.35 
 
 
438 aa  85.5  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  34.25 
 
 
235 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.87 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.05 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.9 
 
 
429 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.67 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.73 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.57 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.65 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.2 
 
 
428 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  32.61 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.73 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  31.65 
 
 
489 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.73 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.94 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.13 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  31.05 
 
 
224 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.55 
 
 
427 aa  82  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  28.14 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  31.86 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  29.84 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  31.51 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  41.13 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  31.37 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  30.53 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.44 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.59 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  30.1 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  30.1 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  30.1 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.8 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.31 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.57 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.13 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.13 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.74 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  35.61 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  32.34 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.35 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  30.69 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.02 
 
 
615 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.22 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.38 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  29.28 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.24 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  33.09 
 
 
615 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>