More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9410 on replicon NC_013596
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  49.76 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  50.72 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  50.95 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  46.23 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  47.24 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  46.8 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  42.06 
 
 		 615 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.5 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  41.51 
 
 		 615 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03177  putative transferase protein  50.48 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  41.23 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03178  putative transferase protein  33.99 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442727  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.41 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  35.08 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  31.49 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  30.57 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  32.56 
 
 		 236 aa  88.6  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  33.15 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.84 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.12 
 
 		 413 aa  84.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  29.7 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  29.7 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.37 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.2 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  28.38 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  32.35 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  30.05 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.96 
 
 		 428 aa  79  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.19 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  28.17 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.55 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  30.35 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  28.76 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  29.32 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  29.5 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  28.76 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.05 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  27.8 
 
 		 439 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.77 
 
 		 428 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.06 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.23 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.9 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  28.03 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.46 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  35 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.28 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.44 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.51 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.12 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  32.26 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01570  conserved hypothetical protein  30.11 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279438  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  27.45 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  30.46 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.41 
 
 		 437 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  29.35 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0386  ribonuclease activity regulator protein RraA  37.96 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  26.34 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.15 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.14 
 
 		 207 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  31.9 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  32 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.12 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  28.87 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  30.39 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.39 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.55 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.15 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.59 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.14 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.75 
 
 		 438 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  29.23 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  28.87 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.28 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.34 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  27.51 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  32.16 
 
 		 545 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.86 
 
 		 427 aa  68.2  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  31.94 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.62 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  29.7 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3716  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.48 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.291445 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.46 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  30.46 
 
 		 286 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.92 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  30.16 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  30.77 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.13 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  27.14 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.8 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.25 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.79 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  26.4 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  30.63 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.74 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  27.66 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.33 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.38 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>