264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0610 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
229 aa  456  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3716  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.94 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.291445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.55 
 
 
236 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  32.74 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  31.84 
 
 
228 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  32.74 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  32.74 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  32.74 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  37.04 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.87 
 
 
227 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.29 
 
 
426 aa  95.9  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.98 
 
 
428 aa  92  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.56 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.13 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  30.88 
 
 
615 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  30.05 
 
 
439 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  29.57 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.67 
 
 
428 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  32.21 
 
 
615 aa  85.5  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.43 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.13 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.37 
 
 
428 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.7 
 
 
438 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.69 
 
 
438 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  32.38 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.7 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.43 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.03 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.62 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.57 
 
 
437 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7865  predicted protein  33.59 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.50782  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.03 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.37 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.37 
 
 
429 aa  75.9  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.5 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3793  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  36.11 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.68 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  26.5 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.94 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.32 
 
 
450 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.07 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  28.43 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.97 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.26 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  27.19 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.08 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.1 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.77 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  29.73 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  26.44 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  26.6 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  28.84 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  25.39 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  29.46 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.85 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.7 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  26.6 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.73 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  25.84 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  30 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  29.37 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  24.77 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  34.48 
 
 
275 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.34 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  33.57 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_003296  RS03177  putative transferase protein  30.62 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.59 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.56 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.42 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  31.68 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  31.15 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.86 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  26.64 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.11 
 
 
196 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  31.9 
 
 
267 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  28.43 
 
 
532 aa  62  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  24.26 
 
 
229 aa  62  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.27 
 
 
211 aa  61.6  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  30.99 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  25.47 
 
 
227 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  27.4 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  26.57 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  29.02 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.05 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.77 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.82 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  27.62 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.34 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.36 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.62 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  28.86 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.47 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  28.47 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.21 
 
 
214 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.16 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.03 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>