223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3793 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3793  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  100 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3507  hypothetical protein  35.22 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3365  hypothetical protein  35.91 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2077  hypothetical protein  33.78 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2219  hypothetical protein  36.1 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4295  hypothetical protein  31.82 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440557  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4084  hypothetical protein  32.73 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3137  hypothetical protein  30.04 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  29.52 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  28.81 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  29.11 
 
 		 505 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  32.5 
 
 		 545 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  29.41 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.11 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  27.8 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  26.38 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  28.18 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  31.47 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  28.37 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  27.88 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  31.47 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  36.04 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  31.47 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  31.47 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  35.94 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  28.05 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  27.54 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  27.06 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  32.93 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  32.54 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  32.93 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  34.38 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  37.5 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  32.93 
 
 		 529 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.79 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  28.4 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  27.52 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  32.54 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.48 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  28.23 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  31.43 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01570  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.07 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  33.7 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  28.36 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  30.17 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  30.37 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.05 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.52 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.43 
 
 		 413 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  33.63 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  32.23 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.75 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.58 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.36 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.55 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.99 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.65 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  29.73 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.46 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  35.11 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.19 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.91 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  26.9 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  29.29 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.45 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.39 
 
 		 428 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  28.24 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  28.83 
 
 		 532 aa  59.3  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.35 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  27.01 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  27.33 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.45 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  24.75 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  31.25 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  26.92 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.3 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.3 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  27.85 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  26.09 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.48 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.67 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.8 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.88 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  30.12 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  29.73 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  31.88 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  27.91 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.87 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  30.28 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  29.37 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  32.38 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  22.81 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.66 
 
 		 429 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  28.3 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>