46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4084 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4084  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3137  hypothetical protein  71.86 
 
 		 236 aa  335  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4295  hypothetical protein  56.14 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440557  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2219  hypothetical protein  44.69 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3507  hypothetical protein  44.39 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2077  hypothetical protein  41.36 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3365  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976866 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3793  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  32.6 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  35 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  31.94 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  32.22 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  29.41 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.8 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.68 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  28.65 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  29.17 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  28.42 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  29.32 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  31.91 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  29.21 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  31.79 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  31.79 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.69 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  28.07 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  29.07 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  29.55 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  31.21 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  26.5 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  29.55 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  28.33 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.52 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  29.24 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.86 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  27.81 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.91 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  25.82 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.14 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  28.18 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.89 
 
 		 426 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  26.42 
 
 		 615 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  32.58 
 
 		 216 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  22.86 
 
 		 192 aa  41.6  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3716  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.291445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.97 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>