249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3140 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  81.22 
 
 		 232 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  77.82 
 
 		 240 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  76.52 
 
 		 232 aa  364  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  76.29 
 
 		 237 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  76.72 
 
 		 237 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  78.92 
 
 		 234 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  74.79 
 
 		 237 aa  358  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  77.06 
 
 		 240 aa  345  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  77.06 
 
 		 240 aa  345  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  76.62 
 
 		 238 aa  344  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  75.76 
 
 		 237 aa  341  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  75.76 
 
 		 239 aa  333  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  72.41 
 
 		 234 aa  317  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  75.33 
 
 		 240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  71 
 
 		 233 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  75.65 
 
 		 233 aa  308  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  70.4 
 
 		 236 aa  294  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  48.44 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  43.7 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.16 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  43.6 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  44.44 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  43.13 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  40.71 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  41.41 
 
 		 239 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  39.33 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  40.09 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  40.45 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  43.18 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  40.47 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  41.63 
 
 		 489 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  40.62 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  42.08 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  39.15 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  38.6 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  41.82 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  40.91 
 
 		 505 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  41.99 
 
 		 545 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  39.91 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  41.01 
 
 		 532 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  38.57 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  37.73 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  36.56 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  38.98 
 
 		 509 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  38.98 
 
 		 509 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  36.12 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  45.92 
 
 		 508 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  38.98 
 
 		 529 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  33.88 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  32.64 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2742  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.33 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.87 
 
 		 615 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.82 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  29.02 
 
 		 615 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  30.57 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.76 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.34 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  30.13 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.65 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.99 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  30.09 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  27.7 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.15 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.04 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  31.13 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  28.7 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.86 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.74 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.16 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  27.78 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.15 
 
 		 413 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.56 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  31.05 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.18 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  32.65 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.4 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  29.66 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.73 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  28.93 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.05 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.07 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.48 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  28.09 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.43 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.22 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.81 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.42 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.12 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_003296  RS03177  putative transferase protein  31.43 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.66 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  31.1 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  30.72 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  29.41 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  27.27 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6068  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  27.66 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  31.84 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  31.84 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>