162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2742 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2742  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 216 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  44.16 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  43.29 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  39.21 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  39.47 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  43.09 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  42.02 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  37.66 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  37.66 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  37.66 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  35.34 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  35.78 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  37.23 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  41.49 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  37.5 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  40.96 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  40.96 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  40.52 
 
 		 233 aa  124  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  40.98 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  40.86 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.46 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  35 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  34.91 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  34.4 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  33.91 
 
 		 237 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  34.39 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  33.18 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  33.48 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  35.22 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  33.19 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  30.57 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  34.96 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  38.83 
 
 		 258 aa  101  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  34.27 
 
 		 241 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  32.44 
 
 		 505 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  31.74 
 
 		 489 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  33.19 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  29.57 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  39.74 
 
 		 508 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  33.77 
 
 		 545 aa  94.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  31.86 
 
 		 532 aa  94  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  32.88 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  31.6 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  31.13 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 529 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  33.03 
 
 		 509 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  33.03 
 
 		 509 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  30.21 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.67 
 
 		 428 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  28.38 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  28.07 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.38 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.81 
 
 		 413 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.05 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  29.76 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.83 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.45 
 
 		 429 aa  68.2  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  33.01 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  29.27 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.01 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.78 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.13 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  29.05 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  25.33 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  24.04 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.79 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.73 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  27.78 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  31.85 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.36 
 
 		 438 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  29.38 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  31.95 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  22.82 
 
 		 437 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  29.1 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.7 
 
 		 426 aa  58.5  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  23.65 
 
 		 438 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.13 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.59 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.39 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  29.52 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.08 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  30.52 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  32.52 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.95 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.09 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  32.59 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  32.59 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  32.59 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  29.27 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  22.65 
 
 		 615 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  23.78 
 
 		 615 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.18 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  31.52 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.94 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  29.25 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.15 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  29.68 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  31.97 
 
 		 281 aa  52.4  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>