215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44651 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  100 
 
 
281 aa  573  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39280  predicted protein  68.35 
 
 
140 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.632179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  38.17 
 
 
238 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  29.63 
 
 
532 aa  101  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  33.82 
 
 
237 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  33.18 
 
 
509 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  33.18 
 
 
509 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  33.18 
 
 
529 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  32.02 
 
 
241 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  36.65 
 
 
508 aa  99.8  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  32.84 
 
 
239 aa  98.6  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  33.96 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  32.84 
 
 
238 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  33.17 
 
 
239 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  31.6 
 
 
236 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  31.7 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  32.68 
 
 
238 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  31.58 
 
 
505 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  33.79 
 
 
545 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  30.93 
 
 
489 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  31.14 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  29.1 
 
 
275 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.55 
 
 
216 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  32 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  30.96 
 
 
236 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  31.51 
 
 
267 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  32.2 
 
 
236 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  30.59 
 
 
237 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  31.22 
 
 
234 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  30.59 
 
 
237 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  29.52 
 
 
241 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  29.55 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  31.1 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  32.47 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  33.72 
 
 
216 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  30.93 
 
 
233 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  33.53 
 
 
233 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  32.74 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  31.67 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  28.8 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.34 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  33.13 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  30.5 
 
 
236 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  30.77 
 
 
241 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  32.28 
 
 
224 aa  82  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.55 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  30.53 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  33.86 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.17 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  33.86 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  32.66 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  28.31 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  32 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.17 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  30.09 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.75 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  31.55 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  30.69 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.05 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.13 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.52 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  31.72 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.58 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  30.63 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  30.89 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  31.29 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.78 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.36 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  30.83 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.35 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  36.97 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.46 
 
 
229 aa  72  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  30.59 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.34 
 
 
429 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  27.19 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.76 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  31.87 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  30.27 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.43 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  30.62 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.9 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  30.62 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  30.62 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  35.82 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  31.16 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  28.78 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  30.06 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  31.49 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.52 
 
 
429 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.54 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.23 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.02 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  29.58 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.75 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.33 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  33.75 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.68 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  29.51 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>