277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3086 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  94.49 
 
 		 238 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  83.9 
 
 		 237 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  81.25 
 
 		 232 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  76.37 
 
 		 240 aa  368  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  77.06 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  78.18 
 
 		 234 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  73.36 
 
 		 237 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  73.8 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  72.49 
 
 		 237 aa  340  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  75.45 
 
 		 232 aa  337  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  73.22 
 
 		 239 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  77.78 
 
 		 240 aa  321  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  74.34 
 
 		 234 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  73.48 
 
 		 233 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  72.93 
 
 		 236 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  75.88 
 
 		 233 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  47.5 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  45.26 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  43.05 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  40.43 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  38.87 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.07 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  38.26 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  38.16 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  38.22 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  36.25 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  39.47 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  41.89 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  38.26 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  39.04 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  38.79 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  37.28 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  37.28 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  37.83 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  40.36 
 
 		 489 aa  154  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  38.6 
 
 		 505 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  37.55 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  41.49 
 
 		 258 aa  151  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  38.18 
 
 		 532 aa  148  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  37.39 
 
 		 236 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  36.05 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  47.75 
 
 		 508 aa  141  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  39.74 
 
 		 529 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  39.74 
 
 		 509 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  39.74 
 
 		 509 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  34.6 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  35.86 
 
 		 275 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  38.77 
 
 		 545 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  33.47 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2742  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.83 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  29.72 
 
 		 615 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.77 
 
 		 615 aa  88.2  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.15 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  32.56 
 
 		 281 aa  85.9  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  36 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  28.83 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.17 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.74 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.84 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  29.81 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  31.37 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.25 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  32 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  29.44 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.03 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  30.04 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.82 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  32.85 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.11 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.56 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.89 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  33.66 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.84 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6068  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  29.95 
 
 		 312 aa  75.1  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  30.04 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.02 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  29.85 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.56 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  30.29 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  30.04 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  30.04 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.65 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.09 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.14 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.77 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.88 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  30.58 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  29.59 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  26.67 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  30 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.27 
 
 		 429 aa  72  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  36.96 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.82 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  30.81 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.69 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  31.35 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  34.86 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.86 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>