252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2625 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  88.41 
 
 		 237 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  87.12 
 
 		 237 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  87.88 
 
 		 232 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  86.27 
 
 		 237 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  77.92 
 
 		 232 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  78.92 
 
 		 239 aa  360  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  73.89 
 
 		 240 aa  344  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  77.99 
 
 		 240 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  77.99 
 
 		 240 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  77.4 
 
 		 238 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  76.13 
 
 		 237 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  73.68 
 
 		 239 aa  318  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  75.98 
 
 		 233 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  71 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  70.19 
 
 		 236 aa  298  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  72.2 
 
 		 234 aa  293  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  71.22 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  46.41 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  47.11 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  43.67 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  39.06 
 
 		 237 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  38.3 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  38.17 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  38.82 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  45.13 
 
 		 258 aa  164  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  36.75 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.65 
 
 		 240 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  37.55 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  38.79 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  39.13 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  37.93 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  35.62 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  36.17 
 
 		 239 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  37.34 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  40.69 
 
 		 489 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  37.34 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  40.6 
 
 		 505 aa  151  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  37.27 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  35.5 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  36.82 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  39.65 
 
 		 509 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  39.65 
 
 		 509 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  36.36 
 
 		 532 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  39.65 
 
 		 529 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  39.27 
 
 		 545 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  34.2 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  43.61 
 
 		 508 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  34.38 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  31.72 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  30.13 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2742  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.36 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  31.3 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  31.22 
 
 		 281 aa  86.3  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  30.81 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.49 
 
 		 615 aa  85.1  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  27.42 
 
 		 615 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.34 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.69 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  30.7 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  34.18 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.91 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.56 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  29.86 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  28.17 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  30.89 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.37 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.41 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  29.38 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.61 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.73 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.77 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.41 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  28.91 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.39 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.95 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1105  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  26.87 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200802  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  31.65 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6068  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  27.05 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  29.13 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  29.19 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.76 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.46 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.61 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.41 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.24 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  29.76 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.99 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  29.63 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  28.72 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.85 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  27.27 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.75 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  30.81 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.61 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.57 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  27.49 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>