144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1105 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1105  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  100 
 
 		 310 aa  638    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200802  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6068  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  56.41 
 
 		 312 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2455  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  55.48 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6067  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  48.51 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.677191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6192  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  48.1 
 
 		 314 aa  314  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.284947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6461  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  47 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.870184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  26.91 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  25.64 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  27.08 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  27.31 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  28.43 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  26.87 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  26.73 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  27.92 
 
 		 241 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  26.4 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  26.4 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  26.79 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  25.55 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  26.07 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  24.9 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  27.23 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  25.42 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  27.59 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  29.44 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  25.23 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  25.73 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  26.53 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  27.27 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  25.32 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  26.37 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  25.32 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  27.43 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  25.77 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  27.43 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  26.22 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  26 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  26.53 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  25.21 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  23.53 
 
 		 545 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  25.63 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  25.39 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  26.32 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  34.78 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  23.29 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.51 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  26.87 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  24.22 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  30.94 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  33.63 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  32.17 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  22.89 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.57 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  25 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  24.87 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  25.11 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  28.81 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  28.74 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  25.74 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  30.43 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  30.7 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.98 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  33.03 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  26.82 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  23.53 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  26.67 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  31.58 
 
 		 227 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  25.21 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  26.98 
 
 		 236 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.37 
 
 		 450 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  29.82 
 
 		 227 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  23.55 
 
 		 508 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2077  hypothetical protein  32.74 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  28.14 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  29.63 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.75 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  28.3 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  28.15 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  32.11 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.39 
 
 		 615 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.98 
 
 		 226 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  27.71 
 
 		 615 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  26.15 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.14 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.14 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  25.94 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  25.91 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.17 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  31.63 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  24.6 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.48 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  31.63 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  24.82 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_003296  RS03178  putative transferase protein  26.36 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442727  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  29.81 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.73 
 
 		 232 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.52 
 
 		 232 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3365  hypothetical protein  30.09 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.82 
 
 		 232 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  28.44 
 
 		 234 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>