172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03178 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03178  putative transferase protein  100 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442727  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  41.9 
 
 		 222 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.44 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  37.8 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  31.82 
 
 		 615 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  30.91 
 
 		 615 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.44 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.45 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.25 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.24 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  33.99 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.78 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  28.64 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.18 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  36 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03177  putative transferase protein  37.8 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  32.51 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.2 
 
 		 438 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  29.38 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.94 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.76 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.5 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.33 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  32.45 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.23 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.83 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  33.87 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  30.15 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.57 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.22 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.29 
 
 		 437 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.3 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.11 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  34.15 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  24.75 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  29.19 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  32.97 
 
 		 235 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.79 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  31.37 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  28.5 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  31.22 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.88 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  24.48 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  31.13 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.57 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.4 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.19 
 
 		 450 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.52 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.73 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.57 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  32.46 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  25.77 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.55 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.79 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.57 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  24.87 
 
 		 428 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.77 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.19 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  30 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.57 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.14 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  29.9 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  30.66 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  28.18 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  28.05 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.43 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.04 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  25.24 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.87 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  26.04 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.94 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3295  demethylmenaquinone methyltransferase  30.99 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  29.25 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.67 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  18.31 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01570  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279438  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  29.47 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  24.39 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.37 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  27.46 
 
 		 286 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.26 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  27.38 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.81 
 
 		 426 aa  52.4  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  32.34 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.88 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.85 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  25.24 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  29.63 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.88 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  25.24 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  25.24 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.54 
 
 		 428 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  23.27 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  28.1 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  26.32 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  23.86 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.93 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>