154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6067 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6067  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  100 
 
 		 311 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.677191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2455  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  62.83 
 
 		 310 aa  411  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6461  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  60.34 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.870184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1105  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  48.51 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.200802  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6192  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  43.59 
 
 		 314 aa  299  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.284947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6068  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  44.88 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  30.04 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  27.78 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  28.63 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  28.27 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  32.14 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  27.43 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  26.64 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  26.72 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  25.86 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  29.6 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  29.85 
 
 		 545 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  28.21 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  26.46 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  24.66 
 
 		 505 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  27.86 
 
 		 532 aa  66.2  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  25.7 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  28 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  24.64 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.57 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  26.92 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  27.92 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  25.5 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  27.8 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  24.45 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  24.88 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  27.35 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  32.48 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  25.95 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.68 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  24.55 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  28.21 
 
 		 508 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  27.72 
 
 		 509 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  27.72 
 
 		 509 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  27.72 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.65 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.93 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  30.83 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  24.86 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  25.13 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.53 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  32.48 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  34.07 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  31.34 
 
 		 216 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 232 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  25.27 
 
 		 224 aa  52.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  27.2 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.36 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  32.38 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2077  hypothetical protein  32.32 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.39 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  29.13 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  24.02 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.17 
 
 		 187 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  23.14 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.74 
 
 		 192 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.09 
 
 		 428 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  25.28 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0205  FldZ protein  32.3 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.233773  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  26.03 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2219  hypothetical protein  29.29 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.2 
 
 		 225 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  25.62 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.75 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.81 
 
 		 450 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.65 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  23.04 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.41 
 
 		 229 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  26.35 
 
 		 237 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.93 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  25.27 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  26.32 
 
 		 223 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  23.53 
 
 		 232 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_003296  RS03178  putative transferase protein  29.23 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442727  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  25.43 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  24.14 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  22.99 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.31 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  25.43 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  28.48 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  24.43 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  26.15 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.36 
 
 		 196 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  26.16 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  28.12 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.03 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.03 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.48 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  28.69 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.12 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  28.69 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  26.11 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>