219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0205 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0205  FldZ protein  100 
 
 
231 aa  475  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.233773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1391  hypothetical protein  43.97 
 
 
257 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00753891  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0608  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  40.34 
 
 
251 aa  139  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0350683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3025  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  38.49 
 
 
284 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0927681  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.35 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  28.77 
 
 
224 aa  88.2  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  33 
 
 
545 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  29.76 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  31.32 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  29.22 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  30.77 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  30.77 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  30.77 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  37.4 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.33 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  29.65 
 
 
237 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  28.96 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  35.77 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  32.42 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  27.88 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  32.1 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.19 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  32.54 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  30.99 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  33.07 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  32.05 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  29.67 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.51 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.78 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  25.85 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  30.77 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.04 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  41.59 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.25 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  30.29 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.27 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  27.78 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.22 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.52 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  29.17 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.43 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  30.82 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  35.94 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  29.58 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  37.11 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.25 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.18 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.34 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  35.05 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  23.48 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  32.6 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  30.77 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  25.81 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.68 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.22 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  26.42 
 
 
615 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  26.57 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  35.94 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  32 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.08 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.62 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  28.83 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  28.32 
 
 
439 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  32 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  27.59 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  31.58 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  29.8 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  25.94 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  30.67 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25 
 
 
438 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.38 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  29.81 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.37 
 
 
438 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  31.33 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25 
 
 
438 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  27.42 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  28.89 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.07 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.25 
 
 
429 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  28.72 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7865  predicted protein  29.63 
 
 
133 aa  62.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.50782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.91 
 
 
208 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.37 
 
 
437 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  36.04 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  28.06 
 
 
231 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  31.87 
 
 
509 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  31.87 
 
 
509 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6067  Demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  32.3 
 
 
311 aa  62  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.677191  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  26.4 
 
 
615 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  31.87 
 
 
529 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  25.77 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.43 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  31.1 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  28.85 
 
 
505 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.56 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.14 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  27.01 
 
 
489 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  30.83 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>