268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1391 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1391  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00753891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3025  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  56.17 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0927681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0608  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  45.57 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0350683  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.81 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0205  FldZ protein  43.97 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.233773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  33.18 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.58 
 
 		 229 aa  92  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  32.85 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  32.27 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  29.69 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  27.92 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  31.28 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.79 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.89 
 
 		 429 aa  82  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  29.9 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.8 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  33.51 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  35.71 
 
 		 545 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  27.16 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.74 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  34.62 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.94 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  30.9 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.17 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.19 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  27.4 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.84 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.63 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.14 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  27.78 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.81 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.47 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  30.41 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  32.03 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.33 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  36.36 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  30.22 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  31.89 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  30.47 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  28.25 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  32.99 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  32.03 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.39 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.19 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  27.98 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  32.16 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.44 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  28.57 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  37.01 
 
 		 509 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  30.52 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  37.01 
 
 		 509 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  37.01 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  30.51 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  26.2 
 
 		 615 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  31.7 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  31.3 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  30 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  30.37 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  32 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  31.3 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  31.3 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  29.21 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.54 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  27.12 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.54 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.82 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.2 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.12 
 
 		 426 aa  68.6  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  32.48 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.23 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.97 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  32.81 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.04 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.47 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.94 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.18 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.44 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  29.38 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  28.88 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  28.26 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  29.94 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.49 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.05 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.17 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.07 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  30.22 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  30.06 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  31.03 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.1 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  34.17 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.79 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  29.94 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.08 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  33.56 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>