125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29980 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_29980  predicted protein  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.650262 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01570  conserved hypothetical protein  34.35 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279438  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  29.73 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  29.13 
 
 		 615 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.39 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  29.23 
 
 		 615 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  34.19 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  26.05 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.63 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.75 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.96 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.32 
 
 		 220 aa  62  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.18 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.23 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.83 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  27.55 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.58 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.98 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  25.54 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.26 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  35.85 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  28.4 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  23.73 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  25.26 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.34 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3793  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  31.86 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  23.85 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  26.82 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.8 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.66 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1063  demethylmenaquinone methyltransferase-like  26.56 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.85 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  29.1 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  24.02 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  23.63 
 
 		 428 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.72 
 
 		 450 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.99 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.23 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.6 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  30.21 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.12 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.67 
 
 		 413 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.84 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  27.5 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  27.34 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  32.29 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.11 
 
 		 427 aa  49.3  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  30.71 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  25.82 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  27.32 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  24.24 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  26.09 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  24.55 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  29.9 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.87 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.1 
 
 		 428 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  31.58 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  21.55 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  22.41 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  26.83 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.15 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.7 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  24.23 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  26.32 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  30.71 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  24.64 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  22.94 
 
 		 438 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  23.92 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.75 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  24.44 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.1 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  23.25 
 
 		 438 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  24.38 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  28.93 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  28.97 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.46 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  23.68 
 
 		 438 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 426 aa  45.4  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  21.98 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  27 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  28.35 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  27.48 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.55 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  27.41 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.48 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.81 
 
 		 429 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  26.88 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  24.76 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.46 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  21.55 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  27.21 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  28 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  25.16 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>