81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0096 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0096  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  100 
 
 		 259 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4024  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  42.75 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0198  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  45.28 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2243  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  44.36 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2676  Phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding, putative  39.69 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.21 
 
 		 450 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1455  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  31.09 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2089  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  30.65 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2699  dehydrogenase  31.69 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647846  normal  0.600019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0336  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.91 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3257  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.88 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3634  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding,-like protein  31.15 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.75811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4431  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.54 
 
 		 286 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182897  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0875  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.69 
 
 		 309 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.39983 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1610  NAD-binding phsophogluconase dehydrogenase-like protein  31.27 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1359  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.17 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234079  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0601  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.15 
 
 		 288 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0286951  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1079  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.79 
 
 		 300 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2716  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.68 
 
 		 304 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1049  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.34 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0780774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5621  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  31.27 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2165  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.12 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  0.0994663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5180  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  28.4 
 
 		 309 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8322  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  30.35 
 
 		 304 aa  89  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0469353  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2815  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.73 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256633  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8622  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  29.07 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.489612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4139  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  29.57 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.37 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5740  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  26.58 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  39.13 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3786  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  27.7 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.5 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1907  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.36 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0274  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.28 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1752  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.38 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6083  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.16 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.662698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1062  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1078  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0733755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01903  putative oxidoreductase  25.42 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1337  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.38 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0431672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  30.42 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4664  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.42 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1787  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.24 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.1 
 
 		 301 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4959  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.39 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3752  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.5 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1308  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.75 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0003  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  27.66 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  hitchhiker  0.00572171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0295  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.23 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4729  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.62 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4243  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.89 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.43 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44120  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.49 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1496  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.17 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.82 
 
 		 287 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0154  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.24 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2354  putative dehydrogenase  29.67 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3876  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.94 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2072  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.07 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3068  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.89 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4482  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.35 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2122  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.71 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.337883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22120  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.76 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4075  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.54 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0409  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.5 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0417  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.5 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3299  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  39.78 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.241837  normal  0.0981124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  40.91 
 
 		 334 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1065  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.73 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1631  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.41 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00030  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  26.21 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000184369  normal  0.343004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3060  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.53 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10765  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase mmsB  33.96 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.17463e-32  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04301  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  30.08 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3935  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.63 
 
 		 295 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4382  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.94 
 
 		 300 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4815  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.64 
 
 		 302 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4901  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.32 
 
 		 300 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0315002  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2156  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.18 
 
 		 299 aa  42  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>