58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8622 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8622  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  100 
 
 		 300 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.489612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5621  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  78.2 
 
 		 304 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8322  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  77.66 
 
 		 304 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0469353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4139  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  76.71 
 
 		 302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2716  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  76.37 
 
 		 304 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3634  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding,-like protein  33.01 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.75811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0875  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.67 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.39983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0336  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.61 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1455  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  34.87 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2699  dehydrogenase  34.57 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647846  normal  0.600019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5180  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.82 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1359  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.53 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234079  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2165  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.22 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  0.0994663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1049  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.46 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0780774  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5740  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  31.85 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1079  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.01 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2815  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.45 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4024  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  31.44 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2089  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  30.89 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3786  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  32.95 
 
 		 293 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2676  Phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding, putative  32.48 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0198  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  32.43 
 
 		 261 aa  99  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.5 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1610  NAD-binding phsophogluconase dehydrogenase-like protein  29.19 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0601  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.78 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0286951  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4431  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.88 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182897  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3257  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.27 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2243  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  28.52 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0096  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  28.15 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.66 
 
 		 450 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6367  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.87 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.707828  normal  0.820897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4075  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.4 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1825  hypothetical protein  27.47 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5899  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.69 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5535  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.69 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.13 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.24 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.47 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6188  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  28.77 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465928  normal  0.388125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.01 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.35 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2433  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  23.9 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1028  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  23.9 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124378  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2085  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.89 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  24.5 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1907  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.37 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00339906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3480  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.27 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  23.67 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.27 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2354  putative dehydrogenase  25.72 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6834  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  23.73 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9609  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.12 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase GcxR  23.15 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.902474  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1759  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  22.53 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  24.51 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.24 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3525  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.79 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.014061  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3294  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  23.67 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>