84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2089 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2089  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  100 
 
 		 295 aa  594  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1359  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  52.04 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234079  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1455  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  50.86 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3634  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding,-like protein  45.27 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.75811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0336  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  47.35 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  48.78 
 
 		 298 aa  234  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2699  dehydrogenase  46.01 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647846  normal  0.600019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0875  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  46.77 
 
 		 309 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.39983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5180  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  40.89 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2165  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.65 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  0.0994663 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5740  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  44.64 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1049  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  39.69 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0780774  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2815  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  45.95 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1079  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.33 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2676  Phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding, putative  36.47 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4024  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  33.2 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1610  NAD-binding phsophogluconase dehydrogenase-like protein  38.31 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2716  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.35 
 
 		 304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8322  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  34.26 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0469353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0198  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  30.86 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5621  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.21 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4139  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  34.25 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2243  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  31.1 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8622  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  30.89 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.489612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3257  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.45 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3786  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  30.97 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0601  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.39 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0286951  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0096  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  30.65 
 
 		 259 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4075  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.94 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4431  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.95 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182897  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.45 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6367  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  28.4 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.707828  normal  0.820897 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6188  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  27.57 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465928  normal  0.388125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0295  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.49 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2443  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase related protein  27.7 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2354  putative dehydrogenase  28.99 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001550  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.56 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0003  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  26.06 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0012708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3042  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.13 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2304  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  28.87 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123265  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8654  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.77 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1825  hypothetical protein  24.49 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4160  hypothetical protein  30.6 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.911147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2413  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.06 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3070  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  28.35 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.220272  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3078  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  24.62 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.231131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2255  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  28.35 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.989431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2095  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  27.84 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00173443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05487  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.56 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1665  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  27.84 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.4 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01512  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.45 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.85 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.69 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  28.28 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.62 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.17 
 
 		 742 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.3 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3081  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  25.19 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3104  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  25.19 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.882169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1416  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  26.24 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0951  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.66 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.012671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3387  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  25.19 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0998501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3412  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  25.19 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3250  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.48 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.9 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0004  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  25.56 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000473013  hitchhiker  0.00414956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.91 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0003  6-phosphogluconate dehydrogenase  23.12 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00950431  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3410  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  24.44 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3180  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  25.19 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3164  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  25.19 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3431  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  25.19 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1845  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  24.44 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3400  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  25.19 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.7 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0003  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  24.73 
 
 		 292 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145093  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.48 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.69 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.23 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1886  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  24.77 
 
 		 323 aa  42.4  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.268097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3294  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.21 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>