90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4024 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4024  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  100 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2676  Phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding, putative  47.45 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0198  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  44.09 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0096  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  42.75 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2243  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  39.76 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.74 
 
 		 450 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2089  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.2 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1359  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.89 
 
 		 296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234079  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1455  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  32.03 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2699  dehydrogenase  33.74 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647846  normal  0.600019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2815  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.73 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1049  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.11 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0780774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0336  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.45 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0875  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.27 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.39983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3634  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding,-like protein  29.41 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.75811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2716  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.51 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1610  NAD-binding phsophogluconase dehydrogenase-like protein  33.82 
 
 		 288 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.87 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1079  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.48 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8622  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  31.44 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.489612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2165  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.62 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  0.0994663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5180  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  28.19 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8322  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  29.78 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0469353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5621  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  30.34 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4139  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  29 
 
 		 302 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3257  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.35 
 
 		 293 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0601  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.23 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0286951  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5740  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  31.18 
 
 		 301 aa  85.1  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4431  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.51 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182897  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3786  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  29.28 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3250  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.91 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0561  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.21 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.081427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1062  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.1 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1078  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.1 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0733755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0295  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.65 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.1 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4075  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.7 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.62 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5846  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.96 
 
 		 290 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3253  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.23 
 
 		 300 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5648  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.01 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3712  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.01 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4656  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.01 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5629  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.18 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.865293  normal  0.0329981 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2413  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.98 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2600  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.68 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00798756  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3405  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.73 
 
 		 305 aa  49.3  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3068  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.05 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0274  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.98 
 
 		 300 aa  48.9  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01903  putative oxidoreductase  25.12 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.7 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5799  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.03 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.0968897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 394 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3256  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.91 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0657335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5125  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.91 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2077  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.05 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1907  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.24 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2354  putative dehydrogenase  29 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0430  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.49 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3409  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.27 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0978  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.45 
 
 		 304 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22120  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.81 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.93 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0234085 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1312  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  27.12 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4321  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.91 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4160  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.911147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2156  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.3 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3011  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.24 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.4 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3332  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.94 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2897  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  30.4 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3742  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.45 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3056  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.49 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.96 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1337  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.48 
 
 		 290 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0431672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1314  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.64 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.848516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7152  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  26.15 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5899  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.22 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5535  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.22 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5498  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.77 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0632  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.41 
 
 		 319 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4518  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.21 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.431597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1214  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.12 
 
 		 303 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.765092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1979  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.73 
 
 		 288 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.15 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.25845  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1097  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.11 
 
 		 295 aa  42  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1453  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.58 
 
 		 296 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.86 
 
 		 402 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2556  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.85 
 
 		 299 aa  42  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>